台灣行政院院長賴清德，在立法院通過2019年度政府總預算後，宣佈總辭。蔡英文隨即召開記者會，宣佈前行政院院長蘇貞昌，將夥拍前立委陳其邁，接任行政院正副院長之職。兩人皆在去年「九合一」選戰中落選，被指「敗部復活」。為接地氣兼立刻上手，「蘇內閣」僅用三日籌組，只有五部會首長為新上任。
記者：盧沛立 互聯網圖片
賴清德表示，民進黨自「九合一」選舉敗選後，身為行政院院長的他責無旁貸，幾經思索下暫時接受蔡英文的慰留，完成行政院排定的多項重要議程。立法院通過預算案後，他認為時間已到，遂決定總辭。賴引述金庸著作《神鵰俠侶》的一句話：「今番良晤，豪興不淺，他日江湖相逢，再當杯酒言歡」，向閣員道別。
接任行政院院長的蘇貞昌則表示，他一直希望全力留住賴清德，接續原有的政策，但賴基於政治責任的理念堅持離開，故只能尊重他的決定。對於接任行政院院長，他以英國前首相邱吉爾為例自詡，指邱在外有強敵、內有政敵情形下，帶領英國度過黑暗時期，又曾以高齡兩度拜相，仍做出亮眼成績。
「人氣最旺」陳其邁接副院長
接任副院長的陳其邁，早前在「九合一」選舉敗予國民黨的韓國瑜，可謂「敗部復活」。作為黨內「中生代」，陳其邁政治歷練完整，他曾在陳水扁主政時期擔任「總統府」的副秘書長、民進黨副秘書長等職務。2005年，他有機會接棒高雄市市長，卻因父陳哲男捲入高雄捷運外勞弊案，而一度退出政壇，陳形容自己是「死了一次再回來」。2018年敗選後，他透過網絡成功轉換形象，吸引不少支持者，被稱為「人氣最旺」的落選人。
「三長之一」的行政院秘書長，則由治水經驗豐富的前台南市代理市長李孟諺擔任。其他行政院部會首長共有五名「新上任」，包括政委龔明鑫、交通部部長林佳龍、農委會主委陳吉仲、環保署署長張子敬、教育部部長潘文忠。實際上，只有前台中巿巿長林佳龍是「新臉孔」，其餘皆是升任或回任。至於一度堅持辭職的文化部部長鄭麗君，最終決定留任，台北故宮博物院院長與海洋委員會主委仍待選任。李孟諺強調，上任後的首要工作，是非洲豬瘟防疫及應對2019年國際經濟形勢。賴清德是繼林全後，蔡英文任期內第二位請辭的行政院院長。賴任內經歷多項內政議題考驗，包括勞動基凖法修正、「一例一休」修法、年金改革、環保政策爭議、普悠瑪列車出軌意外、「九合一選舉」投票混亂、台大校長爭議等。他離任時，共有六個部會首長由署任暫代，包括「促轉會」、中選會、交通部、農委會、環保署，以及教育部。台灣大學台灣發展研究所教授周治邦認為，無論蔡英文任命誰接任行政院院長，其政府都將難改善表現，面對內外壓力，她的連任之路非常艱難。
